האקדמיה לכדורגל של בית"ר ירושלים מהווה את הבסיס של מחלקת הנוער של המועדון, כאשר אליה נרשמים שחקנים בגילאים 5 עד 15 אשר חלומם הוא לשחק בבית"ר ירושלים.
בית הספר הרחיב השנה את פעילותו ופועל לא רק בבית וגן אלא גם באמצעות שלוחות בישובים פסגת זאב, בית שמש (בשיתוף ביה"ס לכדורגל ע"ש שמעון קינן, בניהולו של שחקן העבר אופיר עזו), שדות נגב, חבל לכיש. מטרת בית הספר להתרחב ולהגיע לאזורים נוספים בירושלים ומחוצה לה, על מנת להתרחב ולפתח את הפריפריה.
בית הספר מקנה לילדים הצעירים יסודות במשחק הכדורגל וכמובן את הזכות ללבוש את החולצה והסמל של המועדון אותו הם אוהדים, השחקנים הטובים מבית הספר לכדורגל נבחרים על ידי מאמני מחלקת הנוער לקבוצות הליגה השונות. בנוסף לכך, בית הספר לכדורגל מהווה גשר אל הקהילה ונותן הזדמנות לכל אחד שחפץ בכך להשתלב במועדון בית"ר ירושלים.
